Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trat1Q3UU67 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trat1Q3UU67 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trat1Q3UU67 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms