Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thsd4Q3UTY6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thsd4Q3UTY6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms