Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BB287469Q3UT53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BB287469Q3UT53 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms