Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Elf3Q3UPW2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Elf3Q3UPW2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Elf3Q3UPW2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms