Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa3Q3UPR0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa3Q3UPR0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms