Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ankrd27Q3UMR0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd27Q3UMR0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms