Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LchnQ3UHG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LchnQ3UHG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms