Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Yipf3Q3UDR8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Yipf3Q3UDR8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms