Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf40Q3U319 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf40Q3U319 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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Rnf40Q3U319 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Rnf40Q3U319 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf40Q3U319 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Rnf40Q3U319 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf40Q3U319 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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