Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fndc4Q3TR08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc4Q3TR08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms