Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctdnep1Q3TP92 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdnep1Q3TP92 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms