Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c3Q3TMP1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms