Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uri1Q3TLD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uri1Q3TLD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms