Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3KNL4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3KNL4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms