Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hdgfl1Q2VPR5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdgfl1Q2VPR5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl1Q2VPR5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdgfl1Q2VPR5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms