Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YIL171WYIL171W 330 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YJR023CYJR023C 402 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SIL1YOL031C 1266 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YAR1YPL239W 603 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YPR059CYPR059C 387 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 ARB1YER036C 1833 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RIM4YHL024W 2142 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 FUS2YMR232W 2034 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 GPI17YDR434W 1605 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SNZ3YFL059W 897 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YIL060WYIL060W 435 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 AIM26YKL037W 357 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 GTT2YLL060C 702 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 UBC7YMR022W 498 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 HOR7YMR251W-A 180 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RPL9BYNL067W 576 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SNZ2YNL333W 897 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RDL2YOR286W 450 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 CDC6YJL194W 1542 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 CST6YIL036W 1764 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 AMD1YML035C 2433 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 NOT5YPR072W 1683 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SIA1YOR137C 1869 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 HOM3YER052C 1584 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 VTC2YFL004W 2487 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SIT4YDL047W 936 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YDR048CYDR048C 315 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YDR133CYDR133C 336 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YDR274CYDR274C 372 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YJL202CYJL202C 348 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 MRPL50YNR022C 420 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 AAD15YOL165C 432 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 AAP1YHR047C 2571 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 HXT5YHR096C 1779 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 VPS1YKR001C 2115 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YNL095CYNL095C 1929 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 KAR9YPL269W 1935 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YIR007WYIR007W 2295 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YDR053WYDR053W 396 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RTR2YDR066C 591 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 SMX2YFL017W-A 234 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YGL041CYGL041C 204 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 GOS1YHL031C 672 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 PIR1YKL164C 1026 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 VPS63YLR261C 327 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RIM9YMR063W 720 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 ABF2YMR072W 552 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 YBL108WYBL108W 306 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 MRPL51YPR100W 423 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 RVB1YDR190C 1392 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-BLQ12266 MRK1YDL079C 1506 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 HSP82YPL240C 2130 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 snR59snR59 78 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ENV9YOR246C 993 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YPL114WYPL114W 420 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 LST4YKL176C 2487 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 SIS2YKR072C 1689 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 TOM70YNL121C 1854 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ACC1YNR016C 6702 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 PMT6YGR199W 2280 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 HOM2YDR158W 1098 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 MLC1YGL106W 450 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 BIO2YGR286C 1128 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 LDB18YLL049W 540 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YLR296WYLR296W 327 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 IES4YOR189W 351 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ERI1YPL096C-A 207 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 RRD2YPL152W 1077 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YKU70YMR284W 1809 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ROY1YMR258C 1662 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 RRI2YOL117W 1938 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 MNN2YBR015C 1794 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 HPF1YOL155C 2904 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YEL077CYEL077C 3834 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 IMD2YHR216W 1572 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YME1YPR024W 2244 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 OXP1YKL215C 3861 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 PDC1YLR044C 1692 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 GIP1YBR045C 1920 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YDR537CYDR537C 606 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YGR153WYGR153W 654 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 TEN1YLR010C 483 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 FMP25YLR077W 1752 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ALG11YNL048W 1647 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 SHG1YBR258C 429 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 ABZ1YNR033W 2364 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 SHE4YOR035C 2370 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 VPS52YDR484W 1926 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 SNA4YDL123W 423 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YGL193CYGL193C 312 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-BLQ12266 YGR164WYGR164W 336 nt4.98□□□□□ -1.61
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