Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zc3h18Q0P678 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h18Q0P678 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms