Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Plac8l1Q08EJ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Plac8l1Q08EJ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms