Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms