Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gata4Q08369 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms