Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pou6f1Q07916 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pou6f1Q07916 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pou6f1Q07916 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pou6f1Q07916 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou6f1Q07916 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou6f1Q07916 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms