Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmbpQ07456 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmbpQ07456 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms