Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Siah1bQ06985 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Siah1bQ06985 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms