Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox8Q04886 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox8Q04886 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms