Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RelbQ04863 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RelbQ04863 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms