Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms