Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp11Q02853 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms