Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snai1Q02085 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms