Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms