Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mc1rQ01727 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mc1rQ01727 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms