Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a2Q01149 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms