Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SelpQ01102 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SelpQ01102 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms