Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa1Q00623 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa1Q00623 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms