Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou1f1Q00286 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou1f1Q00286 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms