Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smn1P97801 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smn1P97801 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smn1P97801 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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