Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LystP97412 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LystP97412 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LystP97412 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LystP97412 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LystP97412 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LystP97412 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LystP97412 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LystP97412 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LystP97412 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LystP97412 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LystP97412 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LystP97412 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms