Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMF1P82094 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMF1P82094 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMF1P82094 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMF1P82094 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMF1P82094 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMF1P82094 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMF1P82094 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMF1P82094 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMF1P82094 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms