Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms