Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb1P70662 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ldb1P70662 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldb1P70662 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms