Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stra8P70278 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stra8P70278 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stra8P70278 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Stra8P70278 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms