Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd13P70217 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd13P70217 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms