Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms