Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vbp1P61759 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms