Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1aP61092 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1aP61092 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms