Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfia3P60469 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms