Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ythdf1P59326 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ythdf1P59326 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms