Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms