Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dsc2P55292 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsc2P55292 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms