Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb3P54285 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacnb3P54285 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms