Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FmodP50608 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FmodP50608 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FmodP50608 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FmodP50608 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FmodP50608 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FmodP50608 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FmodP50608 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms